中心实行主任负责制，配有专门的实验室管理人员。中心所有实验室及其仪器设备除了开设常规的实验课程外，其余时间实行预约式开放，师生需在虚拟仿真实验平台上进行预约才能进入实验室，任何用户访问平台均会在后台产生访问数据，管理员可以时刻监控每个用户的行为。 中心的日常维护由实验室管理人员和合作企业技术人员共同承担，同时聘请了部分信息技术能力较强的学生参与平台的维护和管理。学校设有专门的维修部门和专项维修资金，定期为中心的信息化设备进行维护和保养，保证了中心稳定、高效的运转。